Müzede yaklaşık 5250 eser sergilenmektedir.Bu eserler; Paleolitik,Helenistik,Bizans,Osmanlı ve Roma dönemine ait, muhteşem görünümde ve özellikte olan eserlerdir.Müzenin girişinden itibaren bahçesinde ve iç kısmında birbirinden farklı heykeller,mezar kapakları ve sütunlar bulunmaktadır.
Tarihin neredeyse tüm güzelliklerinin barındığı bu müze, Alman Mimar Otto Ritter tarafından çizilmiştir ve 1873-1910 tarihleri arasında,müzenin içerisindeki yapılar inşa edilmiştir. Müzenin içerisinde tamir atölyesi,lojman binası ve su deposu bulunmaktadır.Müzenin yapısında iki adet tekel deposu birleştirilerek,sergilenen eserler için teşhir salonu oluşturulmuştur.Tarihi Gar binalarının kompleksinde yer alan müze,2004 yılında restorasyon çalışmalarına alınmış ve bu çalışmalar 2007 yılına kadar devam etmiştir.2007 yılının başlarında ziyaretçilere açılan müzede bulunan teşhir salonlarının yanında,130 kişilik bir konferans salonu da mevcuttur.
Müzede bulunan eserlerin pek çoğu müze içerisinde yer alırken,büyük bir kısmı da güvenlik önlemleri nedeniyle, bahçede sergilenmektedir.Müzenin yer aldığı kompleksin içindeki binalardan biri,eserlerin incelenmesi ve araştırılması sebebiyle laboratuvar haline getirilmiştir.

Müzenin bahçesinde,giriş kısmında bulunan Mevsim Heykelleri;yaz,kış ve sonbaharı temsil etmektedir.Bu üçlü heykelin dikkat çeken kısmı,tek gövde üzerinde yer alıyor olmasıdır.Bu heykellerden sağda yer alan sonbahar heykelinin ilginç ve üzücü bir hikâyesi vardır.Bu heykel 2001 yılında müzeden çalınmış ve yurt dışına kaçırılmıştır. Aradan bir süre geçtikten sonra ise Almanya’da ki bir müzayede de sergilenen heykel,müze görevlileri tarafından fark edilmiş ve büyük çabalar sonucunda tekrar getirilmiştir...