Şehrin güney doğusunda yer alan İç Kale,surların o kesimdeki parçasını oluşturmaktadır.
Hemen hemen bütün kaynaklar,kalenin yerinde bir Sabii Mabedi'nin bulunduğundan söz etmektedirler.İslâm kaynaklarında,kaleden ilk kez bahseden,El Mukaddesi     (h.4. m.10.asır) burasının Kudüs Kalesi gibi taştan yapıldığını,güzel ve sağlam olduğunu söylemektedir. 
XVII. yüzyılın ortalarında Harran'ı ziyaret eden Evliya Çelebi Harran Kalesi için,"Urfa'dan güney tarafında 9 saat giderek Harran Kalesi'ne geldik.Burayı da Nemrut yapmıştır.Çöl içinde gayet sağlam bir kaledir.Beşgen şeklinde olup sanki usta elinden yeni çıkmış gibidir "demektedir.
Düzensiz dikdörtgen plânındaki Harran Kalesi'nin dört köşesinde onikigen birer kule bulunmaktadır.Bunlardan kuzey batıdaki kule,tamamen yıkılmıştır.Güney doğudaki kulenin dış kısmı yıkılmış olup,iç kısmı ayaktadır.Güney batıdaki ve kuzey doğudaki kuleler ise kısmen ayaktadır...