Kütahya’da bulunan tek padişah camidir.Vakfa Sultan Bayezid Yıldırım Han Camii Şerifi olarak kayıtlıdır.48x26 m. ebadında Kütahya’nın en büyük camisidir.Şehzade Yıldırm Bayezid Germiyan beyi,Süleyman Şah’ın kızı Devlet Şah Hatun ile evlendiğinde Kütahya Valisi iken (1381-1389) bu camiyi yaptırmaya başlamıştır.Ancak seferden sefere koşması ve Ankara Savaşı sonunda Timurleng’e esir düşmesi ve daha sonrada vefat etmesi sebebiyle,camiyi bitirmek (813 H.-1410 M.) oğlu Musa Çelebi’ye nasip olmuştur.Caminin vakfiyesi Fatih Sultan Mehmed Han zamanında tertip olunmuştur.

Kanuni Sultan Süleyman Han,1 Temmuz 1522'de Rodos Seferi'ne giderken Kütahya’da ordusu ile birlikte üç gün kalmış ve Mimar Sinan’a bu güzel camiyi tamir etmesini emretmiştir.1 Temmuz 1534'de de yine Kanuni Irak Seferi'ne çıktığında,dört gün burada kalmış ve namazlarını bu camide kılmıştır.II.Selim şehzadeliğinde Kütahya Valisi iken (1558-1566) babasının vefatını öğrendiğinde,27 Eylül 1566'da Cuma Hutbesi'ni kendi adına okumasını hatibe emretmiş ve böylece padişahlığını bu camide ilân etmiş ve cuma namazından sonra İstanbul’a hareket ederek tahta oturmuştur.

Sakahâne adı verilen şadırvanların suyu,Selçuklu emirlerinden İmadüddin Hezâr Dînârî tarafından getirilmiştir.Sakahâne 1765 yılında Anadolu Eyaleti Valisi olarak bulunan,Hacı Ali Paşa tarafından yeni baştan tamir edilmiştir.Sakahâneden ayrı olarak abdesthaneler de Ali Paşa tarafından tamir ettirilmiştir.Ali Paşa bu tarihte caminin vakfiyesini de tertip ettirip,vakıf mallarına bakma görevi belgesi de mahkeme-i şer'iyye sicillerinde kayıtlıdır...