Caca Bey tarafından,1271-1272 yıllarında bir gözlem evi (rasathane) ve medrese olarak yaptırılmıştır.Yapı,daha sonra camiye çevrilmiştir.Türk bilim adamı,Uluğ Bey’in Batı Türkistan’da kurduğu medrese ne ise,Caca Bey’in kurduğu bu bilim merkezi de aynı derecede öneme sahiptir. Birkaç kez onarılmış olup,minaresindeki mavi çiniler nedeniyle halk arasında Cıncıklı Camii adı ile anılmaktadır.Medrese kesme taştan yapılmış olup kare plânlıdır.Kubbeli medrese yapı tipine dahildir.Minare yapının arka tarafına alınmıştır.
Döneminde,Astronomi Yüksek Okulu olarak hizmet vermiştir. Kubbesi açık ve altında bir kuyunun bulunduğu medresede kuyunun içindeki suya yansıyan yıldızlar incelenir,bunlar üzerinde araştırmalar yapılırdı...